《阿曼尼斯传说 3》直接延续了第二款游戏的故事。骑士 Lyann Fremdes 和他可爱的同伴——精灵 Din，也就是游戏的主人公，前往德玛西亚城，Din 在那里受到了欢迎；当地报纸上甚至有一篇关于她神奇的治疗能力的文章。一切都很顺利，直到英雄们决定访问城市 Magnelia。一支敌对的军队入侵了火车站并屠杀了人们。看起来 Lyann 和 Din 不得不暂时躲起来，在他们想出一个安全的方法来阻止敌人之前——这并不容易，因为敌人似乎拥有先进的技术……

《阿曼尼斯传说 3》在几个方面与前作不同。它有一个更现代的设置，带有蒸汽朋克元素。游戏系统被重新改造，变得更接近于战略 RPG 而不是动作……显示全部 RPG。和以前一样，战斗的特点是自由移动，但现在是回合制，每个角色都有行动点；只要角色还有行动点就可以行动。有一个“活力”系统，可以跟踪人物的体力；一旦活力降低，人物就会开始失去打击点数。使用特殊物品和在旅馆休息可以恢复体力。

游戏还向战略 RPG 迈出了一步，减少了对探索的关注，更多地关注预先设定的、由故事决定的战斗。然而，少量的可控角色和探索能力使它无法成为一个成熟的战略 RPG。