生化尖兵是于 1988 年诞生于任天堂 FC 平台的 2D 卷轴射击游戏《希魔复活》的次世代续作。游戏主人公内森·斯宾塞本是一名忠于职守的政府特工，然而在接受生化改造并为他引以为傲的祖国奋战多年之后，斯宾塞却遭上司陷害而背负了一系列无端罪名，一夜之间从救国救民的超级英雄沦落为了人人得而诛之的国家公敌并被判处了死刑。

然而命运之神并未抛弃我们的主人公，就在斯宾塞即将被行刑的阿森松市，恐怖分子发动的袭击瞬间将城市宜为了平地。出于对恐怖分子的畏惧，政府只得再次向斯宾塞请求援助，主人公就这样再次踏上了为国而战的征程。