《Endless Space 2: Awakening》为游戏引入了可选择的主要派系纳卡琳族以及学院帝国。你现在可以直接和伊西扬德互动和谈判。随着他的宏大计划逐渐展开，以及有关失落族的传言甚嚣尘上，学院开始在银河系的事务中扮演更为主动的角色。

纳卡琳族派系
这个曾经庞大的银河系帝国在他们的神灵，也就是失落族被屠杀之后陷入了衰退的命运。这支由虔诚的探险家们组成的古老种族梦想着有朝一日那些神灵能够回归。他们自身的觉醒证明他们的预言已经实现了一半。那幺剩下的一半呢？
他们在技术方面具有很大的领先优势，但在科学方面却相当落后，只能依靠失落族的文物来学习新技术。他们与学院建立了良好关系，因此有……显示全部权通过他们圣殿的影响力来控制其他星系，将它们皈依为学院所有，为学院效劳（当然，这些行星上的族人可获得丰厚的回报）。

四名纳卡琳族英雄
纳卡琳族是由一群虔诚的探险家、勇士和信徒组成的古老派系。纳卡琳英雄专注于探索，发展星系和外交影响力，并以此来获取丰厚的奖励。

纳卡琳族舰队
作为帝国的工具，纳卡琳舰队拥有强大的防御和探索能力，旨在帮助帝国寻回并控制自古以来就属于他们的领地。

希尔米萨拉族小型派系
希尔米萨拉族是一群对星尘高度敏锐的哲学家，擅长提升星尘收益和开发奇异独特的行星。他们追求平静、能满足和释放其好奇心的生活，不愿因为自身高超的技能而被他人利用。

学院帝国
学院成为一个帝国，也会管理行星系、舰队、以及对新的星球进行殖民。学院领导人伊西扬德会向你发起邀请，要求你为他们的扩张事业做出贡献，并且会奖励你特殊的力量，如学院职位和署名舰船。

学院职位
四种非常强大的学院职位（由伊西扬德授予给对扩张事业做出最多贡献的玩家）：
-“伊桑德尔的长矛”可临时指挥一支学院的攻击主舰队（共两支）及其旗舰“苍白之拳”。
-“星尘大师”掌管着学院金库（作为外交储备）的钥匙，可根据需要提取资金，此外星辰大师还控制着“痛苦总和”船舰。
-“档案库管理员”可选择一支当前没有参议院席位的政党，暂时获取所有关于该政党的法律信息。“意志仪器”船舰也归档案库管理员控制。
-“图书馆员”可购买有关经济学、军事、外交、银河系历史等领域的秘密资料。此外，他们还能控制“知识守护者”船舰。