山村中的女孩珊朵拉，在某天上山采药时得到了一颗具有无限魔力的生命宝石。但是当她回到村子却发现，全村村民都被残忍杀害。为了拯救自己的爷爷以及村民，珊朵拉与时间女神签订合同，回到惨案发生之前，希望能改变一切……

《风之幻想曲 2》是一款半开放式冒险解谜 RPG，以调查解谜为主，新增了独特的策略战斗系统以及养成系统。

与前作《风之幻想曲》不同，本作的剧情将会是非线性展开。在不同的剧情点，玩家将可以选择控制不同的角色进行游戏，推进故事发展，并最终见证以女孩珊朵拉为主角的故事的最后结局。