圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物，而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。

参加圣杯战争的七名由圣杯选出的魔术师被称为 Master，与七名被称为 Servant 的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵，被分为七个职阶，以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组，这七组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。

卫宫切嗣的养子卫宫士郎，偶然地与 Servant 中的剑士（Saber）定下契约，被卷入圣杯战争当中。

在游戏版本中，随着初期选择的不同，后面剧情亦会出现极大改变，共有三线。