在蘑菇王国，碧奇公主、马里奥、路易与众多奇诺比奥在收到邀请后乘飞船到艾斯塔特岛，并遇到方块大叔和 Starlow。之后，他们遇到与库巴合作的蝙蝠王。蝙蝠王意图夺取能达成一切愿望的梦幻石。

因此，马里奥与路易何需要击败蝙蝠王。为了拯救艾斯塔特岛，马里奥进入了路易的梦境，并认识了梦幻路易和梦幻王子。

最后，马里奥与路易遇到了库巴，并粉碎了梦幻石。

可是，库巴吸收了梦幻石的碎片，并进化成梦幻库巴。马里奥与路易成功击败梦幻库巴，并拯救了碧奇公主和艾斯塔特岛。