《神秘岛 III：放逐》将玩者带到十年之后，面对一名新的敌人萨维多（Saavedro）。这名新的反派角色的家园遭到亚楚斯与凯萨琳的儿子 Sirrus 与 Achenar 摧毁，他一直躲藏在亚楚斯的时代之中，伺机报复。

结果亚楚斯不小心自己给了敌人这个机会。他与凯萨琳已经与拥有书写连结书（linking Books）的知识的德尼人民重新建立联系。亚楚斯希望能够看到德尼文明重新获得应有的发展，而他的努力则反而正好提供了这个一心想复仇的人最佳的动力。

玩者将要在几个时代之前追查这名恶徒，破解各种谜题，以发现出这名新敌人背后所隐藏的真相。唯有如此，才能化解危机，拯救千万人的命运。

《……显示全部神秘岛 III：放逐》采用了 Presto 公司革命性的新程式引擎来呈现，同时使用预先绘制的精细背景与即时 3D 图形的技术，结合而成供玩者探索的游戏世界。此外，玩者可以将场景做 360 度的旋转，而且人物动画与场景搭配得天衣无缝，更是令人惊艳。这一切的创新都让游戏世界更具真实感，再加上游戏的场景、剧情与谜题紧密结合，更让玩者能融入神秘岛的世界之中。游戏进行过程中有好几条路线可以分头尝试，不论玩者依任何顺序解开谜题，游戏都能继续进行下去。