《火影忍者 疾风传：究极风暴 3 完全版》作为《火影忍者 疾风传：究极风暴 3》的加强版，收录强化翻新视觉效果的导演剪辑版演出，追加新玩家角色药师兜、宇智波兄弟联手对抗兜的新故事章节，100 种新任务以及 38 种追加下载服装等丰富新要素。