潜行者系列的第二部作品，这款游戏围绕巨型 PSY 风暴的起因展开，你将扮演一名强大的晴空组织成员揭晓一切秘密！

剧情被设置在前作“切尔诺贝利的阴影”故事线之前，在“史特列洛克小队”第一次成功冲击特异区中心后，引发了一场前所未有的巨型 PSY 风暴，导致特异区面貌大改，原来可以走的道路已经被特异点封死 而原来的死路则成为了光明大道。

主角“疤面”是一名雇佣兵，在执行护送科学家任务时遇到巨型 PSY 风暴（即前文所提的那次），随行者无一幸存，但是疤面却奇迹生还，被沼泽地区的“晴空组织”所搭救，逐渐的恢复记忆并试图追查风暴的起因……