不明的未知敌人“虚无者”的出现，改变了战争的本质。战争转变为一场赌上人类生死存亡的斗争。

面对显示压倒性力量的“虚无者”，有效的对抗手段只有“海德系统”与能够身着该系统的“铁翼少女”。

人类的希望“铁翼少女”。在她们作为“铁翼少女”飞翔之际，必须承受牺牲的觉悟与恐惧，以及残酷的“罪业”。
若不战斗人类将会灭亡，然而在战斗的过程中，她们将渐渐失去重要的事物。

这是一部通过２名少女所描绘的“人”的故事……