《决斗联盟》沿用了游戏王初期的世界构架，大家可以在游戏中见到熟悉的海马，城之内，孔雀舞等人物。每个游戏人有自身的等级设定，玩家可通过对战升级该游戏人物，解锁人物技能和游戏人物专属卡牌。

例如，初期的暗游戏，升级之后可获得暗之力技能：开局场上设置有场地魔法卡暗等。而对战可通过点击地图上定时刷新的 NPC 进行展开，获胜后可收入经验和卡牌。随着等级的提升，可开放传送门（和各个经典剧情人物对战，获取专属游戏人物和卡牌）和 PVP。

而 PVP 可与服务器内世界各地的玩家进行匹配博弈，这也是游戏的最大亮点。