《怒之铁拳 3》为横向卷轴清版动作游戏。玩家在游戏中可操作多名角色，消灭屏幕中的敌人。游戏有七个关卡，各关卡最后有强大的头目角色，玩家击败头目后可进入下一关。玩家可以选择关卡的难度。

剧情

游戏日版和美版设定设定差异巨大。

在日版《怒之铁拳 3》中橡木城（虚构地名）发生核爆炸约 3 万人死亡，约 8 万人受伤。国防部部长 Petrov 神秘失踪。炸弹被 Mr.X 遍布利马（虚构地名）各国。利马各国之间的战争很可能就此发生。Blaze 得知这两件事后，给在辛迪加特工作的 Zan 博士写信。于是，Axel、Blaze、Zan、Sammy 这四个人开始行动，整治 Mr.X，制止悲剧……显示全部的再一次发生。

而美版《怒之铁拳 3》中，警察局局长 Petrov 失踪，Blaze 写信请求 Axel 帮助。于是，Axel、Blaze、Zan、Sammy 这四个人开始行动，救出 Petrov，并且整治 Mr.X。

依玩家最终关卡头目战的表现，游戏结局（即 Mr.X 是否被消灭）会有所不同。